法律解析：

孕妇请病假超过三个月，具体处理方式需根据用人单位的规定以及相关法律法规来确定。

当孕妇请病假超过三个月时，可能会引发一系列情况和需要考虑多方面因素。首先，要明确孕妇请病假是基于合法的医疗需求，这是受到法律保护的。用人单位不能因为病假时间较长而对孕妇进行不公正的对待或采取不合理的措施。

从用人单位角度来看，可能会根据自身的规章制度来处理。有些单位可能会要求孕妇提供更详细的医疗证明或定期进行病情更新，以确保病假的真实性和必要性。同时，单位也需要考虑工作安排和运营的实际情况。

对于孕妇自身而言，应及时与单位进行沟通，说明病情和请假的必要性。保持良好的沟通有助于避免误解和不必要的纠纷。并且，要按照单位的要求提供相应的证明材料。

在法律层面，孕妇享有特殊的权益保护。例如，在孕期、产期、哺乳期，用人单位不得随意解除劳动合同。如果单位在处理孕妇病假问题上存在不合理或违法的行为，孕妇可以通过法律途径来维护自己的权益。

此外，孕妇也应注意自身的健康和安全，按照医生的建议进行治疗和休息。不要因为担心工作等问题而忽视了身体状况。同时，要了解自己的权益和义务，以便在遇到问题时能够正确应对。

总之，孕妇请病假超过三个月需要综合考虑多方面因素，通过合理的沟通和遵循相关规定来妥善处理。

法律依据：

《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条、第四十七条、第八十七条

《女职工劳动保护特别规定》第五条、第七条