综合工时制的员工有年休假。

综合工时制是一种特殊的工时制度，但这并不影响员工依法享有年休假的权利。年休假是劳动者的一项重要法定权益，旨在保障劳动者能够有时间休息、放松和恢复精力，与具体的工时制度并无直接关联。根据相关法律法规，机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作 1 年以上的，享受带薪年休假。单位应当保证职工享受年休假。职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。 无论员工实行的是标准工时制还是综合工时制等其他工时制度，只要符合上述连续工作时间的条件，就有权享受年休假。综合工时制主要是针对因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业的部分职工，采用的以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的工时制度。 在实践中，企业应当按照法律规定合理安排员工的年休假，确保员工能够充分行使这一权利。如果企业违反规定不安排员工休年休假，或者不按照规定支付未休年休假工资报酬，员工可以通过法律途径维护自己的权益。

《职工带薪年休假条例》 第二条

机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假（以下简称年休假）。单位应当保证职工享受年休假。职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。

第三条

职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天；已满10年不满20年的，年休假10天；已满20年的，年休假15天。

国家法定休假日、休息日不计入年休假的假期。