法律解析：

可以通过收集相关交易记录、邮件往来、证人证言、视听资料等多种方式来取证。

当怀疑员工吃回扣时，取证工作需要谨慎进行。以下是一些常见的取证方法。

查看公司的财务记录、采购合同、发票等文件，寻找异常的交易或价格差异。这可能会揭示出与正常业务模式不符的情况。

检查员工的电子邮件、短信、即时通讯记录等，看是否有涉及回扣的沟通内容。

寻找证人。与其他员工、供应商等可能了解情况的人进行交流，看是否能获取有用的信息和证言。

视听资料也是重要的证据。例如，通过安装监控设备或在合法的情况下进行录音录像，获取员工与相关方的谈话或行为。

分析员工的银行流水、账户交易记录等，看是否有异常的资金流入。

在取证过程中，要确保所有的行为都是合法合规的，避免侵犯员工的合法权益。同时，要注意证据的完整性和关联性，使其能够形成有力的证据链。

取证工作可能需要一定的时间和精力，但只有充分的证据才能在后续的处理中占据主动。如果证据确凿，可以依据公司的规章制度和法律法规对涉事员工进行相应的处理，如警告、罚款、解除劳动合同等，严重的还可能涉及刑事犯罪。

法律依据：

《劳动争议调解仲裁法》第六条

发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。

第三十九条

当事人提供的证据经查证属实的，仲裁庭应当将其作为认定事实的根据。

劳动者无法提供由用人单位掌握管理的与仲裁请求有关的证据，仲裁庭可以要求用人单位在指定期限内提供。用人单位在指定期限内不提供的，应当承担不利后果。