法律解析：

法院在某些特定情形下可以直接认定医疗机构存在过错，例如医疗机构伪造、篡改或者销毁病历资料，以及违反法律、行政法规、规章以及其他有关诊疗规范的规定等。

在医疗纠纷的处理中，法院拥有一定的权力和依据来直接认定医疗机构存在过错。其中一种常见的情形是当医疗机构故意伪造、篡改或者销毁病历资料时。病历是医疗过程的重要记录，对于判断医疗行为是否得当以及患者的病情发展具有关键作用。如果医疗机构对病历进行不合法的处理，这将严重影响对事实的查明和责任的判定，法院通常会据此认定医疗机构存在过错。

另外，医疗机构违反法律、行政法规、规章以及其他有关诊疗规范的规定，比如未按照规定告知患者病情、医疗措施、医疗风险等，或者未按照规定进行医疗操作，如手术前未进行必要的检查、未遵循无菌操作原则等，法院也可能直接认定其存在过错。

再者，隐匿或者拒绝提供与纠纷有关的病历资料，这同样会被法院视为医疗机构存在过错的表现。因为病历资料是解决医疗纠纷的重要证据，医疗机构有义务提供完整、真实的病历，如果拒绝提供，就难以证明其医疗行为的合法性和合理性。

还有一种情况，医疗机构遗失、伪造、篡改或者违法销毁病历资料，这也会让法院倾向于认定其存在过错。因为这种行为破坏了医疗证据的完整性和真实性，使得公正公平地处理医疗纠纷变得困难。

总之，在医疗纠纷案件中，法院会综合各种证据和具体情况来判断医疗机构是否存在过错。上述几种情形只是常见的可能导致法院直接认定过错的情况，但并非涵盖了所有可能性。最终的判断还需依据具体的法律规定和案件的实际情况来确定。

法律依据：

《民法典》第一千二百二十一条

医务人员在诊疗活动中未尽到与当时的医疗水平相应的诊疗义务，造成患者损害的，医疗机构应当承担赔偿责任。

第一千二百二十二条

患者在诊疗活动中受到损害，有下列情形之一的，推定医疗机构有过错：

（一）违反法律、行政法规、规章以及其他有关诊疗规范的规定；

（二）隐匿或者拒绝提供与纠纷有关的病历资料；

（三）遗失、伪造、篡改或者违法销毁病历资料。