法律解析：

三方协议和劳动合同是两种不同的协议，存在多方面的区别。三方协议是毕业生、用人单位和学校三方签订的，主要是为了明确毕业生就业的意向和相关事项；而劳动合同是劳动者与用人单位之间签订的，用于确立双方的劳动关系，规定双方的权利和义务。

首先，签订主体不同。三方协议的签订主体是毕业生、用人单位和学校。而劳动合同的签订主体是劳动者和用人单位。

其次，签订时间不同。三方协议是在毕业生在校期间签订的，一般在毕业前。而劳动合同是在毕业生正式毕业后，到用人单位报到后签订的。

再者，目的不同。三方协议主要是为了保障毕业生的就业权益，同时也为学校了解毕业生的就业情况提供依据。它更多地是一种就业意向的约定。而劳动合同则是为了明确劳动者和用人单位之间的劳动关系，规定双方的权利和义务，是劳动关系的法律依据。

然后，内容不同。三方协议的内容主要包括毕业生的基本情况、就业意向、用人单位的基本情况及接收毕业生的意愿、学校的有关意见等。而劳动合同的内容则更加具体和详细，包括工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬、社会保险、劳动保护、劳动条件等。

最后，法律效力不同。三方协议虽然具有一定的法律效力，但更多的是一种民事协议，违反三方协议的责任主要是民事责任。而劳动合同则是受劳动法律法规调整的，具有更强的法律效力，违反劳动合同可能会承担行政责任甚至刑事责任。

总之，三方协议和劳动合同在签订主体、签订时间、目的、内容和法律效力等方面都存在着明显的区别。毕业生在就业过程中，需要正确认识和区分这两种协议，以维护自己的合法权益。

法律依据：

《中华人民共和国劳动合同法》 第七条

用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。用人单位应当建立职工名册备查。

《中华人民共和国劳动合同法》 第十条

建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。

已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。

用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。