协议离婚后房产证更名流程包括准备材料、办理析产公证、办理更名手续等；费用主要有契税、印花税等，具体费用标准因地区而异。

协议后办理房产证更名，首先要准备相关材料，如离婚证、离婚协议书、房产证、双方身份证等。接着，可能需要办理析产公证，以明确房产的归属。

然后进入更名手续办理阶段。双方一同到房产所在地的房产交易中心，填写房产过户申请表等相关表格，提交准备好的材料。交易中心工作人员会对材料进行审核，审核通过后，缴纳相关费用。

关于费用方面，一般可能涉及契税，具体税率根据当地政策和房产情况而定。还有印花税等少量费用。需要注意的是，不同地区的收费标准和具体要求可能存在差异。

在办理过程中，要确保材料的真实性和完整性。如有必要，可以提前咨询当地的房产管理部门或专业人士，了解详细的流程和费用情况，以便顺利完成房产证更名。

办理更名时要注意办理时间和工作流程，避免因材料不全或不符合要求而多次往返奔波。同时，要妥善保管好相关的证件和文件，以备后续可能的需要。

《中华人民共和国民法典》 第二百零九条

不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。

依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。

《中华人民共和国民法典》 第二百一十条

不动产登记，由不动产所在地的登记机构办理。

国家对不动产实行统一登记制度。统一登记的范围、登记机构和登记办法，由法律、行政法规规定。