如果员工离职未及时做减员，应尽快进行减员操作，并根据具体情况采取相应措施来处理可能产生的问题。

当发现员工离职后未及时做减员时，首先要做的就是尽快完成减员手续。这可以通过相关的人力资源管理系统或向社保等相关部门提交申请来实现。

同时，需要关注可能由此带来的一些影响。比如，可能会多缴纳一段时间的社保费用等。如果涉及到多缴纳的费用，需要与离职员工进行沟通协商，看如何处理。有些情况下，可能需要员工退还多缴纳的部分；而在另一些情况下，公司可能会考虑自行承担。

还要注意可能引发的法律问题。例如，如果因为未及时减员导致员工在离职后仍享受了某些权益，而这些权益本不应再享有，那么可能会引发纠纷。为避免此类情况，公司应保留好相关的证据，如离职申请、离职手续等，以证明员工确实已经离职。

公司应反思为何会出现这种情况，是流程上的漏洞还是人员疏忽导致。并据此对相关流程进行完善和优化，明确各环节的责任人和时间节点，以避免类似问题再次发生。同时，加强对相关人员的培训，提高其对这类问题的重视程度和处理能力。

总之，一旦发现员工离职未及时做减员，要迅速采取行动，妥善处理可能出现的各种问题，并从根源上进行改进，确保公司的人力资源管理工作更加规范和有效。

《中华人民共和国劳动合同法》第五十条

用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。

劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。

用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。