有些情况下，催收员可能会以各种理由扣除你与他们协商好的还款金额，这可能是因为以下原因：

1、误解或沟通不畅：在协商过程中，可能存在信息误解或沟通不清晰的情况，催收员可能没有正确理解你的还款计划或扣除方式。

2、第三方费用：有些债务可能涉及第三方机构或服务提供商，他们可能会对还款进行扣除或收取费用。

3、逾期利息和滞纳金：如果你逾期还款，可能会产生额外的利息和滞纳金，这些费用可能会从你的还款中扣除。

4、系统错误：偶尔也可能出现系统错误或数据录入问题，导致还款金额被错误扣除。

建议参考：

1、保留证据：在与催收员协商还款时，尽量保留所有的沟通记录，包括邮件、短信、电话录音等，这些证据可以在出现问题时帮助你维护自己的权益。

2、仔细阅读合同：了解你与债权人之间的合同条款，包括还款方式、扣除规定和逾期后果等，如果你对某些条款有疑问，及时咨询专业人士。

3、要求书面确认：在协商达成一致后，要求催收员或债权人提供书面确认，明确还款金额、扣除方式和还款期限等重要信息。

4、关注账单：定期检查你的账单，确保还款金额与你协商的一致，并注意是否有任何额外的扣除。

5、与债权人直接沟通：如果遇到问题，直接与债权人联系，解释你的情况，并要求他们解决问题。

相关法条：

《中华人民共和国民法典》第五百七十七条规定：当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。

小编总结：

在与催收员协商还款时，要保持警惕，确保自己的权益得到保护，如果遇到还款金额被扣除的问题，首先要找出问题的原因，并采取相应的措施解决，了解相关的法律法规可以帮助你更好地维护自己的权益，如果你无法解决问题，可以寻求法律援助或咨询专业律师的意见。