一、有违约金的合同是否超诉讼时效

合同违约金的诉讼时效期间为三年。自当事人知道或者应当知道其权利受到侵害之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护；有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

二、违约金的补偿内容是什么

违约金的性质是一种补偿，补偿对象是违约方因为未履行合同业务而给其他缔约方造成的损失，如何开具发票，取决于违约金的补偿内容。

当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金。违约金的性质是一种补偿，补偿对象是违约方因为未履行合同业务而给其他缔约方造成的损失。因此，如何开具发票，取决于违约金的补偿内容。一般而言，违约金补偿的内容分为以下两种。

（一）接受方补偿提供方的损失

例如A、B两家企业签订销售合同，约定A企业向B企业销售货物一批，B企业自行到A企业指定的第三方仓库将货物运走。如果B企业未在约定时间运走货物，导致A企业为了贮存货物而多向仓库运营方支付保管费用，则B企业向A企业支付违约金用于弥补这种损失，属于《增值税暂行条例实施细则》第十二条列举的“价外费用”，应当由A企业向B企业开具发票，B企业凭取得的发票在企业所得税前扣除。

（二）提供方补偿接受方的损失

承上例，如果A企业迟延交付货物，造成B企业产生损失，则A企业向B企业支付的违约金即用于弥补此种损失，此时B企业作为收款方是否应向A企业开具发票?答案是否定的，因为B企业作为买方没有向A企业提供商品或服务，此项违约金系卖方A企业履行义务瑕疵而承担的补偿责任，属于销售折让的范畴，因此应当由A企业向B企业开具红字发票，A企业凭红字发票的记账联冲减收入并在企业所得税前扣除。

以上两种情形都是合同履行中发生违约而产生的违约金。除此之外，还有一种违约金是补偿性质的，是在合同义务未履行即宣告解除的情况下产生的。

（三）不应开具发票的违约金

当事人一方在法律规定的范围内可以向对方给付定金。债务人履行债务后，定金应当抵作价款或者收回。给付定金的一方不履行债务的，无权要求返还定金；接受定金的一方不履行债务的，应当双倍返还定金。

如果合同因未履行而发生定金没收或双倍返还的情形，因为合同义务未履行，没有发生增值税应税行为，因此这种违约补偿不能开具发票。因为定金被没收的一方或双倍返还定金的一方应当凭借签订的合同、支付凭证或其他生效的法律文书如判决书)作为支付费用的凭证在企业所得税前扣除。

承上例，假设A企业与B企业约定，由B企业向A企业支付合同定金，而后B企业因故反悔而解除了合同，则A企业因为没有实际履行合同，没收的定金就不能向B企业开具发票。B企业可以用银行付款凭证作为企业所得税前扣除的依据，并在凭证后附带支付定金所依据的合同。

三、诉讼时效经过的法律后果

(一)权利人的胜诉权消灭

在我国现行民事立法上，依据《民法典》的规定，以及第153条的规定，“当事人超过诉讼时效期间起诉的，人民法院应予受理。受理后查明满，发生胜诉权消灭的法律效果。这表明在我国现毛事立法上，诉讼时效期间届满，当事人并未丧失程序上的诉权，即起诉权。因此当事人在护住时效期间届满后仍有权起诉，法院发受理，而不能裁定顺起诉。法院受理后，应依职权宴厅昏厥昌否届满。法院经审查认定诉讼时效期间届满的，应以判决驳回碑的诉讼请求。

考虑到诉讼时效期间届满时，取得的时效利益属于私人利益。因此就诉讼时效期间是否届满，国家无主动干预必要。

(二)义务人的自愿履行

依《民法典》的规定，超过诉讼时效期间，当事人自愿履行的不受诉讼时效限制。因此，于诉讼时效完成后，义务人自愿履行其义务的，权利人可受领其履行而不不当得利，义务人于履行后反悔的，不得诉请权利人返还其所得。对于义务人已同意履行，但尚未履行的情形，最高人民法院1997年4月16日发布的(1997)4号批复中指出，根据《民法典》的精神，对超过诉讼时效期间，当事人双方就原债务达成还款协议的，应当依法予以保护。

(三)时效利益的抛弃

所谓时效利益的抛弃，是指义务人在时效期间届满以后，以明示或默示的方式抛弃其取得的时效利益。尽管时效利益不得预告抛弃，但一旦时效期间届满，义务人取得的时效利益属于其私人利益，应遵循私法自治原则，允许其抛弃。时效利益一旦抛弃即视为时效期间未届满，重新开始时效期间的计算。

从上可知，有违约金的合同也属于合同纠纷，而对于该合同一般适用普通诉讼时效，即三年时效期间。以上便是合飞律师小编为您带来关于有违约金的合同是否超诉讼时效的相关知识，若大家有什么不了解的亦或是有其他疑问，可以咨询合飞律师的律师。