法律解析：

社保卡和农村合作医疗在适用范围、保障内容、管理方式等方面存在区别。

社保卡是由人力资源和社会保障部统一规划，由各地人力资源和社会保障部门面向社会发行，用于人力资源和社会保障各项业务领域的集成电路（IC）卡。它包含了医疗保险、养老保险、失业保险、工伤保险、生育保险等多种社会保障功能。

农村合作医疗，现在多称为城乡居民基本医疗保险，主要是针对农村居民（也包括城镇非从业居民）的一项医疗保险制度。

在适用范围上，社保卡的适用人群更广泛，包括城镇职工和城乡居民等；而农村合作医疗主要针对农村居民。

保障内容方面，社保卡所涵盖的保障内容较为全面，除了医疗还有其他社保项目；农村合作医疗则主要聚焦在医疗保障上。

管理方式也有所不同。社保卡通常由社保部门统一管理和运营；农村合作医疗一般由当地卫生部门或相关机构负责管理。

此外，在报销比例、报销范围等方面也可能存在差异。社保卡中的医疗保险根据不同地区和参保类型，有相应的规定；农村合作医疗也有其特定的报销政策和标准。

总之，社保卡和农村合作医疗虽然都是为了保障民众的健康和医疗需求，但在具体的实施和运作上存在诸多区别。人们在选择和使用时，应根据自身的情况和需求，了解清楚相关政策和规定，以便更好地享受相应的保障和福利。

法律依据：

《中华人民共和国社会保险法》第二十六、第二十八条