产权不明的房屋在离婚时的判决是一个相对复杂的问题。需要明确的是，产权不明的房屋指的是在婚姻关系存续期间，双方没有对房屋的产权进行明确约定或登记的情况。

在离婚时，法院通常会根据实际情况和相关法律法规进行判决。以下几个因素会被考虑：

1. 房屋的购买资金来源：如果房屋是由一方或双方的个人资金购买，那么在离婚时，该房屋的产权往往归属于购买方。如果房屋是由夫妻共同出资购买，那么产权可能会按照双方出资比例进行分配。

2. 房屋的登记情况：如果房屋已经登记在一方的名下，那么在离婚时，该房屋的产权很可能归属于登记方。如果另一方能够证明自己对该房屋有实际的贡献，比如支付了一定的购房款项或参与了装修等，那么法院可能会考虑对该方给予一定的补偿。

3. 夫妻共同生活和贡献：如果夫妻双方在婚姻关系存续期间共同生活、共同贡献，但是房屋的产权归属不明确，法院可能会根据夫妻双方的贡献情况进行判决。例如，如果一方在婚姻期间负责了家庭的生活开支、子女的抚养教育等，那么法院可能会考虑给予该方一定的补偿或分配房屋产权。

产权不明的房屋在离婚时的判决需要根据具体情况进行综合考虑，法院会根据相关法律法规和双方的情况进行裁决。双方可以通过协商、调解等方式解决产权归属问题，如果无法达成一致，可以向法院提起诉讼，由法院判决最终结果。