经济补偿金不满一年个税的扣除要区分情况。若经济补偿收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税；超过3倍数额的部分，不并入当年综合所得，单独适用综合所得税率表计算纳税。

根据相关税收政策规定，对于个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入（包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费用），有明确的税务处理办法。

明确一个关键的免税额度标准。当地上年职工平均工资3倍数额是一个重要的界限。当经济补偿金不满一年且补偿收入在这个3倍数额以内时，这部分金额是免征个人所得税的。例如，某地区上年职工平均工资为5万元，那么3倍就是15万元。若个人获得的不满一年的经济补偿金是10万元，由于10万元小于15万元，这10万元无需缴纳个人所得税。

若经济补偿金超过当地上年职工平均工资3倍数额，超过的部分需要进行纳税计算。计算方式是不并入当年综合所得，而是单独适用综合所得税率表来计算纳税。具体步骤为，先计算出超过3倍数额的部分，然后查找综合所得税率表对应的税率和速算扣除数进行计算。比如，该地区上年职工平均工资还是5万元，个人获得不满一年的经济补偿金为20万元，超过3倍数额的部分就是20 - 15 = 5万元。假设按照综合所得税率表，这5万元对应的税率为10%，速算扣除数为2520元，那么应纳税额就是50000×10% - 2520 = 2480元。

在实际操作中，用人单位通常会在支付经济补偿金时代扣代缴个人所得税。纳税人也应该关注自身的纳税情况，确保税务处理的准确性。同时，不同地区的上年职工平均工资标准不同，具体的免税额度和纳税计算也会有所差异。

《中华人民共和国劳动合同法》 第四十七条

经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。