个人申请工伤鉴定单位不配合，个人依然可以自行申请，按规定准备材料向劳动保障行政部门提出工伤认定申请，之后按流程进行劳动能力鉴定等手续。

在工作中，当个人申请工伤鉴定而单位不配合时，不必慌张，仍有合法途径可以维护自身权益。根据《工伤保险条例》规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。如果用人单位未在规定的时限内提交工伤认定申请，在此期间发生符合本条例规定的工伤待遇等有关费用由该用人单位负担。

若单位不配合申请，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。申请时需准备一系列材料，包括工伤认定申请表，该表应包括事故发生的时间、地点、原因以及职工伤害程度等基本情况；与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）、人事关系的其他证明材料，如劳动合同、工资发放记录、工作证等；医疗机构出具的受伤后诊断证明书或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。

社会保险行政部门受理工伤认定申请后，根据审核需要可以对申请人提供的证据进行调查核实，用人单位、工会组织、医疗机构以及有关部门负责安排相关人员配合工作，据实提供情况和证明材料。如果单位还是不配合调查，不影响工伤认定的进行。

在完成工伤认定后，职工可向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出劳动能力鉴定申请，进行伤残等级等鉴定，后续依据鉴定结果享受相应的工伤待遇。如果单位拒绝承担应有的责任，职工可以通过劳动仲裁、诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。

《工伤保险条例》 第十七条

职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。

用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。