个人申请工伤鉴定单位不配合，个人依然可以自行申请，无需单位同意。在申请时需准备好相关材料，按规定流程进行。若单位不提供必要材料或对认定结果不配合后续处理，个人可通过法律途径维护自身权益。

根据《工伤保险条例》规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。如果用人单位未在规定的时限内提交工伤认定申请，在此期间发生符合本条例规定的工伤待遇等有关费用由该用人单位负担。

当单位不配合申请工伤鉴定时，受伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。

个人申请工伤认定需准备一系列材料，包括劳动、聘用合同文本复印件或者与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）、人事关系的其他证明材料，如工资发放记录、工作证、考勤记录等；医疗机构出具的受伤后诊断证明书或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。

在申请过程中，如果单位拒绝提供相关材料，例如不肯出具劳动关系证明等，职工可以通过其他途径收集证据来证明劳动关系，如同事的证人证言、工作中的邮件往来记录等。

若社会保险行政部门受理工伤认定申请后，根据审核需要可以对申请人提供的证据进行调查核实，用人单位、工会组织、医疗机构以及有关部门负责安排相关人员配合工作，据实提供情况和证明材料。如果单位拒不配合调查，社会保险行政部门可以根据调查结果依法作出工伤认定决定。

如果单位对工伤认定结果不配合后续处理，如拒绝支付工伤待遇等，职工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院，通过法律手段维护自己的合法权益。

《工伤保险条例》 第二十一条

职工发生工伤，经治疗伤情相对稳定后存在残疾、影响劳动能力的，应当进行劳动能力鉴定。

第二十三条

劳动能力鉴定由用人单位、工伤职工或者其近亲属向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出申请，并提供工伤认定决定和职工工伤医疗的有关资料。