医保卡挂号费用通常是按照当地医保政策规定的比例或金额进行扣除。

医保卡挂号费用的扣除方式会因地区、医保类型以及具体政策而有所不同。一般来说，在挂号时，医院的收费系统会自动识别参保人的医保卡信息。

对于职工医保，可能会有一定比例的挂号费用可以通过医保卡个人账户支付。个人账户中的资金是由个人和单位缴纳的部分组成。有些地区可能规定了具体的扣除金额上限。

城乡居民医保的扣除方式也会根据当地政策执行。有些地方可能会给予一定的报销比例，患者只需支付自付部分。

医保政策还可能对不同级别的医疗机构、不同的挂号类型（普通号、专家号等）有不同的规定。

在扣除过程中，医院的信息系统会准确计算并完成相应的扣费操作。参保人可以在缴费时留意收费明细，了解具体的扣除情况。

需要注意的是，为了确保医保卡能够正常使用，参保人应按时缴纳医保费用，保持医保的有效性。同时，了解当地医保政策的具体规定，以便在就医过程中更好地享受医保待遇。如果对挂号费用的扣除有疑问，可以向医院的医保窗口或当地医保部门咨询。

《中华人民共和国社会保险法》第二十八条

符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。

第二十九条

参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。

社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。