特别重大事故通常由国务院负责组织调查处理。

特别重大事故是指造成特别重大人身伤亡或者巨大经济损失以及性质特别严重、产生重大影响的事故。

在我国，对于特别重大事故的处理有着明确的规定和层级划分。国务院负责组织特别重大事故的调查处理工作。这是因为特别重大事故的影响范围广泛、后果极其严重，需要更高层级的政府部门来统筹协调各方面的资源和力量，以确保事故得到全面、深入、公正的调查和处理。

国务院组织调查处理特别重大事故具有多方面的重要意义。能够保证调查的权威性和公正性。国务院具有更高的行政层级和更广泛的协调能力，可以有效地整合各相关部门和专业机构的力量，避免地方保护主义等因素对调查的干扰。有利于从更高的层面和更宏观的角度来分析事故的原因和教训，从而制定出更具针对性和全局性的防范措施和政策。能够提高事故处理的效率和透明度，及时向社会公布调查结果和处理意见，回应公众的关切，增强政府的公信力。

同时，国务院在处理特别重大事故时，也会依法依规进行，充分保障相关当事人的合法权益，确保事故处理的合法性和公正性。通过这样的机制，不断提高我国在安全生产等领域的管理水平和应对重大突发事件的能力，保障人民群众的生命财产安全和社会的稳定发展。

《生产安全事故报告和调查处理条例》第十九条

特别重大事故由国务院或者国务院授权有关部门组织事故调查组进行调查。

重大事故、较大事故、一般事故分别由事故发生地省级人民政府、设区的市级人民政府、县级人民政府负责调查。省级人民政府、设区的市级人民政府、县级人民政府可以直接组织事故调查组进行调查，也可以授权或者委托有关部门组织事故调查组进行调查。

未造成人员伤亡的一般事故，县级人民政府也可以委托事故发生单位组织事故调查组进行调查。