法律解析：

分居后判决离婚时抚养权的归属，一般会从子女的最佳利益出发，综合考虑父母双方的抚养能力、抚养条件、子女意愿等多方面因素来判定。

在分居后判决离婚抚养权归属问题上，法院通常会遵循以下原则和考虑因素。会考虑子女的年龄。年幼的孩子，特别是哺乳期内的，一般会判给母亲抚养，除非母亲存在不适合抚养的情形。对于较大的孩子，其自身的意愿会被重视。父母的抚养能力是关键。包括经济收入、生活稳定性、教育背景、品德等方面。稳定的经济收入能保障孩子的基本生活需求，良好的品德和教育背景有利于孩子的成长和教育。孩子的生活环境也很重要。如果孩子长期与一方生活，形成了稳定的生活环境和社交关系，轻易改变可能对孩子不利。父母双方的身体状况、工作性质和时间等也会影响抚养权的判定。如果一方身体不好或工作过于繁忙无法照顾孩子，可能会处于劣势。法院会综合衡量所有因素，以确定哪一方更能为孩子提供良好的成长条件和关爱。当然，在判决后，不直接抚养孩子的一方仍有探望孩子的权利和义务，这也是为了孩子的身心健康发展。总之，抚养权的判定是一个复杂且个体化的过程，需要根据具体情况进行综合考量。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。