男方不能生育通过试管婴儿生育的孩子，在离婚后抚养权的归属需要综合多方面因素来判定，不能一概而论。

在这种情况下，确定孩子抚养权归属是一个复杂的问题，需要依据具体情况进行分析。法院会考虑孩子的年龄、性别、健康状况、生活环境等因素。年幼的孩子通常更倾向于跟随母亲生活，因为母亲在照顾年幼孩子方面可能更具优势。双方的经济状况、抚养能力也是重要考量因素。如果一方有更好的经济条件和抚养能力，能够为孩子提供稳定的生活和良好的教育资源，这可能对争取抚养权有利。孩子的意愿也可能被考虑，尤其是对于年龄较大、有一定认知能力的孩子，他们的意见可能对抚养权的判定产生影响。

需要注意的是，虽然男方不能生育，但这并不意味着孩子就一定会归女方所有。法院会以孩子的最佳利益为出发点进行综合权衡。比如，男方虽然不能自然生育，但可能在其他方面能够为孩子提供良好的成长条件。而女方如果存在一些不利于孩子成长的因素，如经济困难、生活不稳定、有不良习惯等，也可能会影响其获得抚养权。

在实际处理中，双方可以通过协商达成一致意见，如果协商不成，由法院依法判决。同时，无论抚养权最终归属于哪一方，另一方都享有探视孩子的权利，并且有义务支付抚养费，以保障孩子的生活和教育需求。总之，抚养权的确定需要全面考虑各种因素，以确保孩子能够在一个有利于其身心健康成长的环境中生活。

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。