100万股权转让要交多少税，要看情况而定。法人股东或自然人股东股权转让100万元需缴纳25%或20%的所得税，以及印花税和契税。股权转让给个人，应纳税所得额为转让财产收入减去财产原值和合理费用后的余额，个人所得税按20%的税率缴纳。如果转让方以原价转让的，不交个人所得税。股权转让企业，则根据情况确认是否缴纳企业所得税。此外，还需按转让金额的万分之五缴纳印花税。实缴股权不可以0元转让。

按照法律规定，申报的股权转让收入明显偏低且无正当理由的，主管税务机关可以对股权转让收入进行核定。如果申报的股权转让收入低于股权对应的净资产份额，则认为股权转让收入明显较低。股权转让收入由主管税务机关按照净资产核定法、类比法等合理方法依次核定。

法律依据：

第三条 个人所得税的税率：

(一)综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率;

(二)经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率;

(三)利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。