后孩子判给女方但在男方，办理户口迁移的流程如下：

1. 女方需持本人身份证、户口簿、、孩子的等相关证明材料，到孩子户口所在地的派出所提出户口迁移申请。

2. 派出所对女方提交的材料进行审核，审核通过后，会为女方开具户口迁移证。

3. 女方持户口迁移证，到拟迁入地的派出所办理户口迁入手续。

需要注意的是，不同地区的具体办理流程和要求可能会有所差异。在办理前，女方可以先咨询当地的户籍管理部门，了解详细的办理流程和所需材料，以便顺利完成户口迁移手续。

《中华人民共和国户口登记条例》 第十条

公民迁出本户口管辖区，由本人或者户主在迁出前向户口登记机关申报迁出登记，领取迁移证件，注销户口。

公民由农村迁往城市，必须持有城市劳动部门的录用证明，学校的录取证明，或者城市户口登记机关的准予迁入的证明，向常住地户口登记机关申请办理迁出手续。

公民迁往边防地区，必须经过常住地县、市、市辖区公安机关批准。

《中华人民共和国户口登记条例》 第十九条

公民因结婚、离婚、收养、认领、分户、并户、失踪、寻回或者其他事由引起户口变动的时候，由户主或者本人向户口登记机关申报变更登记。