法律解析：

申请支付令和起诉主要有程序、条件、效力等方面的区别。

在程序上，申请支付令相对简便快捷。债权人只需向有管辖权的法院提出书面申请，法院受理后进行审查，符合条件的即可发出支付令；而则需要经过一系列较为复杂的诉讼程序，包括立案、送达、举证、庭审等环节。

条件不同。申请支付令要求债权债务关系明确、合法，且债权人与债务人没有其他债务纠纷，支付令能够送达债务人；则相对宽泛，只要有具体的诉讼请求和事实、理由，属于法院管辖范围即可。

效力方面也有差异。支付令发出后，债务人在法定期间内未提出异议又不履行支付令的，债权人可以向法院申请强制执行；而起诉经过审理作出判决后，当事人不履行判决的，也可申请强制执行。但起诉后可能会经过一审、二审等程序，时间可能较长。

另外，支付令的费用通常较低。相比之下，起诉的诉讼费用可能会稍高一些。

申请支付令可以快速解决一些简单、明确的债权债务纠纷，提高纠纷解决效率。但如果债务人提出异议，支付令则会失效，案件可能会转入诉讼程序。起诉则更适合复杂的案件或双方争议较大的情况，通过诉讼程序充分保障当事人的权利。在实际应用中，债权人应根据具体情况选择合适的方式来维护自己的权益。

法律依据：

《中华人民共和国民事诉讼法》 第二百二十五条

债权人请求债务人给付金钱、有价证券，符合下列条件的，可以向有管辖权的基层人民法院申请支付令：

（一）债权人与债务人没有其他债务纠纷的；

（二）支付令能够送达债务人的。

申请书应当写明请求给付金钱或者有价证券的数量和所根据的事实、证据。