法律解析：

申请支付令和起诉主要有程序、条件、效力等方面的区别。

申请支付令与存在多方面的不同。在程序上，申请支付令相对简便快捷，债权人只需向有管辖权的法院提出书面申请，法院受理后经审查符合条件的即可发出支付令；而起诉则要经过较为复杂的诉讼程序，包括立案、送达、举证、开庭审理等环节。

条件也有差异。申请支付令要求债权债务关系明确、合法，且债务人没有提出异议；起诉则没有这方面的特别限定，只要符合民事诉讼法规定的起诉条件即可。

效力方面，支付令自送达债务人之日起生效，若债务人在法定期间内提出异议，支付令即失效，债权人需另行起诉；起诉后经法院审理作出判决，判决具有终局性和强制执行力。

从费用角度看，申请支付令的费用通常低于起诉的费用。

从时间成本来说，支付令能较快地确定债权，如果债务人不异议，债权人能迅速实现债权；而起诉通常需要更长时间。

在实际运用中，债权人应根据具体情况选择合适的方式。如果债权明确且债务人异议可能性较小，支付令是一种高效的途径；若情况较为复杂或存在不确定因素，起诉可能更稳妥。总之，两者各有特点，债权人应权衡利弊后作出决策。

法律依据：

《中华人民共和国民事诉讼法》 第二百二十一条

债权人请求债务人给付金钱、有价证券，符合下列条件的，可以向有管辖权的基层人民法院申请支付令：

（一）债权人与债务人没有其他债务纠纷的；

（二）支付令能够送达债务人的。

申请书应当写明请求给付金钱或者有价证券的数量和所根据的事实、证据。