如果协议离婚后女方不配合办理房产证，可以通过法律途径来解决，比如向法院提起诉讼。

协议后，遇到女方不配合办理房产证的情况，确实会给当事人带来困扰和麻烦。可以尝试与女方进行沟通和协商，明确告知其配合办理房产证的重要性和必要性，看是否能通过友好协商解决问题。

如果协商无果，那么就需要考虑通过法律手段来维护自己的权益。可以向法院，要求女方履行离婚协议中关于房产办理的义务。在诉讼过程中，需要提供相关的证据，如离婚协议、房产证明等，以证明自己的主张。

法院会根据具体情况进行审理和判决。如果判决女方应当配合办理房产证，而女方仍然拒绝执行，那么可以申请法院强制执行。法院可以采取多种措施来迫使女方履行义务，比如对其进行罚款、拘留等。

在办理房产证的过程中，也可以寻求房产管理部门或相关专业机构的帮助和建议，了解具体的办理流程和要求，以便更好地解决问题。

总之，遇到这种情况不要慌张，要保持冷静，通过合法合理的途径来解决问题。同时，在离婚协议中应当明确双方的权利和义务，避免出现类似的纠纷。要坚定地维护自己的合法权益，确保房产权益能够得到妥善的处理和保障。

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十六条

夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。

离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。