分公司注销后欠总公司的借款，总公司可通过法律途径等方式进行追讨。

当分公司注销后存在欠总公司借款的情况，总公司有几种途径来处理。首先，总公司应及时梳理与分公司之间的往来账目和相关证据，包括借款合同、转账凭证、往来邮件或通信记录等，以明确债权的存在和具体金额。

如果分公司在注销过程中依法进行了清算，总公司可以依据清算结果和相关法律规定，向负责清算的主体主张债权。清算主体有义务按照法律要求处理债务问题。

若清算过程中存在违规或未妥善处理债务的情况，总公司可以向相关部门投诉或，要求纠正违规行为并保障自身权益。

在法律途径方面，总公司可以向法院提起民事诉讼，要求分公司的相关责任人或其他有义务承担债务的主体偿还借款。法院会根据具体情况和证据进行审理和判决。

此外，总公司也可以尝试通过协商、调解等非诉讼方式来解决问题。与相关责任人进行沟通，寻求双方都能接受的解决方案，可能会更加高效和节省成本。

总之，总公司在面对分公司注销后欠借款的情况时，要积极采取行动，利用合法途径来维护自身权益。同时，在日常经营中，也应加强对分公司的财务管理和监督，以避免类似问题的发生。

《中华人民共和国公司法》 第十四条

公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。

公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。

《中华人民共和国公司法》 第三条

公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。

有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。