法律解析：

申请分居两年离婚手续，一般需要先证明分居事实，然后通过诉讼或协议的方式办理离婚。

在法律上，因感情不和分居满两年是认定夫妻感情破裂的情形之一。要申请分居两年手续，首先要明确如何证明分居事实。以下是一些常见的证明方式，比如双方签订的分居协议，明确记载分居的起始时间和原因等；居住地址的证明，如租房合同等显示双方分别居住在不同地点；证人证言，了解情况的亲朋好友可以作为证人证明分居情况等。

如果选择诉讼离婚，当事人可以向有管辖权的法院提起，并提交相关证据证明分居两年的事实。法院会根据证据和法律规定进行审理和判决。在诉讼过程中，双方可以就财产分割、子女抚养等问题进行协商或由法院依法判决。

若选择协议离婚，双方应就离婚意愿、财产分割、子女抚养等问题达成一致意见，并签订离婚协议书。然后共同到婚姻登记机关申请离婚登记。虽然分居两年是离婚的一个理由，但协议离婚并不一定需要提供分居的具体证据。

需要注意的是，分居两年并不是自动离婚，必须通过法定程序办理离婚手续。同时，在分居期间，双方也应当妥善处理财产和子女等问题，避免产生不必要的纠纷。在整个过程中，建议咨询专业律师，以获得更准确和详细的法律建议和指导，确保自身合法权益得到最大程度的保护。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。