一般情况下，男方失踪起诉离婚，孩子大概率会归女方抚养。

在男方失踪的情况下，孩子的抚养问题需要综合多方面因素来考虑。从实际情况来看，由于男方失踪，无法履行对孩子的抚养义务和照顾责任，而孩子需要稳定的生活环境和照顾者，女方作为孩子的主要照顾者之一，在这种情况下更有可能获得抚养权。法院在判定抚养权归属时，会以子女的最佳利益为原则。这包括考虑孩子的年龄、身心健康、生活习惯、教育需求等。如果孩子一直以来主要由女方照顾，与女方有深厚的感情，那么将孩子判给女方更有利于孩子的成长和发展。女方的经济状况、居住条件等也是需要考虑的因素，但并非是决定性的。如果女方能够提供稳定的生活和教育环境，有能力照顾好孩子，那么在男方失踪的情况下，她获得抚养权的可能性就更大。当然，如果有其他合适的亲属或监护人愿意并且有能力承担抚养孩子的责任，法院也可能会考虑将抚养权判给他们。但无论如何，法院的最终目的都是为了确保孩子能够得到妥善的照顾和关爱，保障孩子的合法权益。

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。