医保局通常会根据相关规定和流程，通过一定的结算方式将款项返给药店。

医保局向药店返款是一个涉及多方面因素和流程的过程。药店需要与医保局签订服务协议，明确双方的权利和义务，包括结算方式、返款标准等。

在日常运营中，药店会按照医保政策为参保人员提供药品销售等服务，并实时上传相关数据至医保信息系统。医保局会对这些数据进行审核和统计。

审核过程中，医保局会检查药店的服务是否符合医保规定，如药品的合规性、收费的合理性等。一旦审核通过，医保局会根据约定的结算周期进行结算。

结算方式可能包括电子支付、银行转账等。医保局会将应返款的金额按照相应的渠道支付给药店。

在这个过程中，医保局还会对药店进行监管，以确保其规范运营。如果发现药店存在违规行为，如虚假申报、违规收费等，医保局不仅可能暂缓或停止返款，还可能对其进行处罚。

不同地区的医保政策和返款流程可能会有所差异，药店需要密切关注当地医保局的相关规定和通知，以确保能够及时、准确地获得返款。

总之，医保局返款给药店是一个基于政策和协议的规范化过程，需要药店合规运营并积极配合医保局的工作。这不仅关系到药店的经济利益，也对医保制度的健康运行具有重要意义。

《中华人民共和国社会保险法》第二十八条

符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。

第二十九条

参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。

社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。