法律解析：

首先需要明确女方的真实意愿和具体情况，然后双方进行充分沟通协商，也可寻求专业法律帮助，根据实际情况选择合适的处理方式。

当女方怀孕三个月提出时，这是一个较为复杂和敏感的情况。以下是一些建议来妥善处理：

一是保持冷静与理性。双方都应避免在情绪激动时做出仓促决定，以免日后后悔。

二是深入沟通。男方应积极与女方交流，了解她提出离婚的原因，看是否有可能解决导致离婚的问题。

三是考虑女方的身体和心理状况。怀孕时期女方的身心状态特殊，要给予充分的关心和照顾。

从法律角度来看，如果双方能达成一致意见，可以通过协议离婚的方式，对财产分割、子女抚养等问题作出明确约定。如果无法协商一致，女方可以向法院离婚。但法院在审理时，通常会更加谨慎，会综合考虑女方怀孕的情况以及双方的具体情况。

男方在此情况下，也有一些需要注意的点。比如，不能强迫女方继续维持婚姻关系。同时，要承担起对女方和未出生孩子应尽的责任和义务，包括经济上的支持等。

总之，处理女方怀孕三个月提出离婚的情况，需要综合考虑多方面因素，以平和、理性的态度，通过沟通协商或法律途径来解决，尽可能减少对各方的伤害。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。