法律解析：

不算。

事实婚姻是指没有配偶的男女，未进行登记，便以夫妻关系同居生活，群众也认为是夫妻关系的两性结合。而分居三年与是否构成事实婚姻并无直接关联。

在我国，自 1994 年 2 月 1 日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以后，男女双方符合结婚实质要件的，人民法院应当告知其在案件受理前补办结婚登记；未补办结婚登记的，按解除同居关系处理。也就是说，1994 年 2 月 1 日之后，不存在事实婚姻的说法，只有依法登记的婚姻才受法律保护。

即使双方曾经存在婚姻关系，但分居三年后，如果没有办理手续，在法律上仍然是夫妻关系；如果办理了离婚手续，那么就不再是夫妻关系，也不存在事实婚姻一说。

需要注意的是，同居关系与婚姻关系存在诸多区别。在婚姻关系中，夫妻双方享有一系列的权利和义务，如相互扶养的义务、财产分割的权利等。而同居关系中，双方的权利义务则相对较少，且在法律上的保护程度也较低。

总之，分居三年不能简单地等同于事实婚姻，要根据具体情况来判断双方的法律关系。如果对自身的婚姻状况存在疑问或纠纷，建议咨询专业，以获得准确的法律建议和指导。在法律领域，准确理解和把握各种概念和规定是非常重要的，避免因误解而导致不必要的法律风险和后果。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十六条

夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十八条

婚姻登记机关查明双方确实是自愿离婚，并已经对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的，予以登记，发给离婚证。