1、抵扣时，增值税专用发票能抵扣，增值税普通发票不可以抵扣。

2、开具发票时，增值税专用发票需要购货方详细的资料信息，增值税普通发票则不需要。使用时，增值税专用发票是无限制时间的，增值税普通发票的使用期限是2个月。

3、只有增值税一般纳税人才能开具增值税专用发票。作为既有普通发票又有增值税专用发票的单位来说，开具这两种发票所交的税都是一样的(两种发票税率是一样的)。

增值税专用发票是由国家税务总局监制设计印制的，只限于增值税一般纳税人领购使用的，既作为纳税人反映经济活动中的重要会计凭证又是兼记销货方纳税义务和购货方进项税额的合法证明;是增值税计算和管理中重要的决定性的合法的专用发票。

普通发票是指在购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动中，所开具和收取的收付款凭证。它是相对于增值税专用发票而言的。

任何单位和个人在购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动中，除增值税一般纳税人开具和收取的增值税专用发票之外，所开具和收取的各种收付款凭证均为普通发票。