在离婚案件中，关于两个孩子的抚养权问题，法院通常会根据孩子的最佳利益来做出决定，法官会考虑多个因素，包括但不限于父母的抚养能力、孩子的年龄、孩子的意愿（尤其是较大孩子的情况）、父母与孩子的关系、父母的居住和工作状况、孩子的教育和医疗需求等，在一些情况下，如果父母双方都有抚养能力，法院可能会考虑将一个孩子判给父亲，另一个孩子判给母亲，以保持孩子的稳定生活环境，在其他情况下，如果一方有明显不适合抚养孩子的情形，法院可能会将两个孩子都判给另一方，最终的抚养权判决是根据案件的具体情况来决定的。

建议参考：

在处理两个孩子抚养权的问题时，父母双方应尽可能地协商一致，如果无法达成一致，应通过律师的专业意见来保护自己的权益，在法庭上，提供充分的证据和合理的理由来支持自己的抚养权请求是非常重要的。

相关法条：

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条：“父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除，离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则，已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决，子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。”

小编总结：

在处理两个孩子抚养权的问题时，法院会根据孩子的最佳利益来做出决定，父母双方应尽可能地协商一致，如果无法达成一致，应通过律师的专业意见来保护自己的权益。《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条为处理离婚后的子女抚养问题提供了法律依据。