南京边要离婚的程序可以按照以下步骤进行：

第一步：准备材料

双方需要准备好离婚所需的材料，包括结婚证、身份证、户口簿等证明身份的文件，以及双方共同财产的相关证明文件。

第二步：协商解决

在准备好材料后，双方可以选择协商解决离婚事宜。双方可以通过对话、谈判等方式达成一致，确定离婚的具体事项，如财产分割、子女抚养等。

第三步：申请离婚

如果双方无法协商一致，可以向当地的婚姻登记机关或法院递交离婚申请。申请时需要填写相关表格，并提交所需的材料。

第四步：调解或审理

一般情况下，婚姻登记机关或法院会安排调解员对双方进行调解，帮助双方达成和解。如果调解无效，法院将进行审理，双方需要参加庭审并提供相关证据。

第五步：判决或调解协议

法院根据双方的证据和法律规定，作出离婚判决或调解协议。判决或协议中会涉及财产分割、子女抚养、探望权等具体事项。

第六步：执行判决或协议

离婚判决或调解协议生效后，双方需要按照判决或协议的要求履行义务。如有财产分割，双方需要按照判决或协议进行分割；如有子女抚养问题，双方需要按照判决或协议履行抚养义务。

南京边要离婚的程序主要包括准备材料、协商解决、申请离婚、调解或审理、判决或调解协议、执行判决或协议等步骤。在整个过程中，双方需要合作、理性对待，以达成对双方都公平合理的离婚解决方案。