房屋他项权证一般由抵押人（通常是房屋所有权人）和抵押权人（通常是银行等金融机构）共同申请办理，在实际操作中，多由借款人（抵押人）配合，由贷款银行或金融机构负责具体的办理事宜。

房屋他项权证是房屋产权登记机关颁发给抵押权人或者典权人等他项权利人的法定凭证。从法律规定和实际流程来看办理主体的情况如下：抵押人和抵押权人共同申请。根据相关规定，以房屋设定抵押的，当事人应当申请抵押权登记。申请抵押权登记，应当由抵押人和抵押权人共同到当地的房地产管理部门提出申请。这是因为抵押行为涉及到双方的利益，抵押人通过抵押房屋获得资金，而抵押权人则通过抵押保障债权的实现。所以双方都有义务参与到他项权证的办理过程中，提供必要的文件和资料。实际多由金融机构主导办理。在实际的房屋抵押贷款业务中，由于贷款银行或金融机构对办理流程更为熟悉，并且为了确保自身的抵押权得到有效保障，通常会负责具体的办理事宜。借款人（抵押人）需要配合金融机构，提供办理他项权证所需的个人资料，如身份证、房产证等，并按照要求签署相关文件。金融机构会准备好申请材料，包括抵押合同、借款合同等，然后到房地产管理部门办理登记手续。在办理过程中，金融机构会跟进各个环节，确保他项权证能够顺利办理下来。当他项权证办理完成后，金融机构会收执该证书，以此作为其对抵押房屋享有抵押权的证明。直到借款人还清全部贷款本息后，金融机构才会配合借款人办理他项权证的注销手续。

《城市房地产抵押管理办法》 第三十条

房地产抵押合同自签订之日起30日内，抵押当事人应当到房地产所在地的房地产管理部门办理房地产抵押登记。

《城市房地产抵押管理办法》 第三十三条

登记机关应当对申请人的申请进行审核。凡权属清楚、证明材料齐全的，应当在受理登记之日起7日内决定是否予以登记，对不予登记的，应当书面通知申请人。

《城市房地产抵押管理办法》 第三十四条

以依法取得的房屋所有权证书的房地产抵押的，登记机关应当在原《房屋所有权证》上作他项权利记载后，由抵押人收执。并向抵押权人颁发《房屋他项权证》。以预售商品房或者在建工程抵押的，登记机关应当在抵押合同上作记载。抵押的房地产在抵押期间竣工的，当事人应当在抵押人领取房地产权属证书后，重新办理房地产抵押登记。