电瓶车着火烧了别人的车，赔偿问题主要取决于火灾的原因和责任归属。

若火灾是由电瓶车自燃或电瓶车充电线路引起的，则电瓶车车主应承担赔偿责任。在这种情况下，被烧毁的车主可以向电瓶车主索赔。若电瓶车车主能证明火灾是由于产品缺陷或其它外部原因造成的，则可向有关责任方追偿。

如果火灾是由第三方的过错或不当行为引起的，例如有人故意纵火或扔烟头，第三方应承担责任。在这种情况下，被烧毁的车主可以向第三方索赔。若不能确定具体的责任人，被烧毁的车主可能需要通过法律手段进行赔偿。

在赔偿过程中，首先要确定烧毁车辆的实际价值，这通常需要由专业的评估机构进行评估。接着，根据责任归属和实际情况，协商确定赔偿金额和方法。如双方不能达成协议，争议可能需要通过诉讼等方式解决。

法律依据：

《民法典》第一千一百八十二条

侵害他人人身权益造成财产损失的，按照被侵权人因此受到的损失或者侵权人因此获得的利益赔偿;被侵权人因此受到的损失以及侵权人因此获得的利益难以确定，被侵权人和侵权人就赔偿数额协商不一致，向人民法院提起诉讼的，由人民法院根据实际情况确定赔偿数额。

第一千一百八十三条

侵害自然人人身权益造成严重精神损害的，被侵权人有权请求精神损害赔偿。

因故意或者重大过失侵害自然人具有人身意义的特定物造成严重精神损害的，被侵权人有权请求精神损害赔偿。

第一千一百八十四条

侵害他人财产的，财产损失按照损失发生时的市场价格或者其他合理方式计算。