安全员证书变更公司的流程通常如下：

1. 了解相关规定：首先需要了解当地主管部门对于安全员证书变更公司的具体要求和规定。

2. 准备材料：一般包括原公司的证明、新公司的劳动、个人、安全员证书原件等。

3. 网上申请：登录当地相关的证书管理，填写变更申请信息，并上传所需的证明材料。

4. 提交审核：确保申请信息和材料准确无误后提交审核。

5. 等待审批：主管部门会对提交的申请进行审批，审批时间根据当地情况而定。

6. 领取新证书：如果审批通过，按照规定的方式领取变更后的安全员证书。

需要注意的是，不同地区的具体流程和要求可能会有所差异，建议在办理变更前，详细咨询当地的建设主管部门或相关机构，以确保变更流程顺利进行。

《建筑施工企业主要负责人、项目负责人和专职安全生产管理人员安全生产管理规定》 第五条

“安管人员”应当通过其受聘企业，向企业工商注册地的省、自治区、直辖市人民政府住房城乡建设主管部门（以下简称考核机关）申请安全生产考核，并取得安全生产考核合格证书。安全生产考核不得收费。