航行中的船只发生火灾，导致汽车受损或烧毁，责任认定与赔偿问题需要区分以下几种情况：

一、汽车海上烧毁了怎么办赔偿

1. 船方责任

如果火灾是由于船方操作不当、设备故障或疏忽大意造成的，船方应当承担赔偿责任。船方应向保险公司报案，并配合保险公司对事故原因进行调查。如果事故涉及第三方责任，船方还需承担相应的赔偿责任。

2. 货主责任

如果火灾是由货主运输的货物所致，如货物本身具有易燃易爆性，或者货主未能正确申报货物的性质，导致船舶发生火灾，则货主应当承担赔偿责任。

3. 其他责任

如果火灾是由第三方的过错造成的，如其他船舶碰撞或人为纵火，则由第三方承担赔偿责任。

4. 赔偿范围

赔偿范围一般包括汽车的损失、运输费用、保险费、以及其他合理费用。

二、汽车海上烧毁了如何申请赔偿

1. 及时报案

汽车烧毁后，应立即向船方和保险公司报案，并提供详细的事故信息。

2. 收集证据

收集所有能够证明事故原因和损失的证据，如事故现场照片、船方记录、货运单据等。

3. 委托律师

如果赔偿金额较大或事故责任复杂，建议委托律师协助处理，以保障自己的合法权益。

4. 协商赔偿

与船方或保险公司协商赔偿金额，根据事故责任比例和损失情况进行合理分配。

三、汽车海上烧毁了保险怎么理赔

1. 确定保险范围

确认汽车运输保险是否涵盖海上火灾风险。

2. 提交理赔申请

向保险公司提交理赔申请，并提供事故证明材料。

3. 保险公司调查

保险公司将对事故原因进行调查，并评估损失情况。

4. 赔付金额

保险公司根据保险合同和事故责任比例，确定赔付金额。

汽车海上烧毁的赔偿问题涉及责任认定、赔偿范围、申请流程和保险理赔等方面。遇此情况，应及时报案，收集证据，在必要时寻求法律援助，并根据相关规定和保险合同要求合理索赔。