事实婚姻分居是指未办理结婚登记手续，但以夫妻关系同居生活的男女一方或双方提出解除同居关系。当事实婚姻关系破裂，一方或双方想要结束这段关系时，就需要考虑办理的问题。

一、事实婚姻分居怎么办证

1.协议离婚：如果双方对离婚和财产分割等事项达成一致，可以共同向户口所在地的婚姻登记机关申请协议离婚。需要提供户口本、身份证、等材料。

2.诉讼离婚：如果一方不同意离婚，或者双方对离婚或财产分割存在争议，则可以向有管辖权的人民法院提起。需要提供起诉状、证据材料等文件。

二、领取事实婚姻解除证明书

如果事实婚姻关系存续期间，双方未办理结婚登记手续，在分居后想要取得离婚证明，可以向原户口所在地的婚姻登记机关申请领取事实婚姻解除证明书。需要提供以下材料：

1. 双方的户口簿和身份证；

2. 证明事实婚姻关系的材料，如证人证言、共同生活照片等；

3. 分居满1年以上或感情确已破裂的其他证据。

三、事实婚姻子女抚养权和财产分割

事实婚姻关系存续期间，子女的抚养权由双方协商确定。如果协商不成，可以向法院起诉解决。事实婚姻关系中的财产分割，原则上参照婚姻法的规定进行分割。

事实婚姻分居后办理离婚证的方式取决于双方的意愿和具体情况。需要注意的是，事实婚姻关系不受法律保护，在财产分割、子女抚养等方面存在一定的风险和不确定性。建议在进入事实婚姻关系前慎重考虑。