法律解析：

父女关系证明一般是由派出所开具。

在证明父女关系时，派出所通常是更主要的开具机构。派出所具有户籍管理的职能，能够通过户籍档案等信息来核实和确认父女关系。

村委会虽然在基层事务中也有一定的作用，但在证明父女关系这方面，其权威性和准确性可能相对较弱。因为村委会对居民具体户籍信息的掌握可能不如派出所全面和准确。

派出所开具父女关系证明时，会依据相关的户籍登记资料进行核实。如果户籍信息明确显示了父女关系，那么开具证明相对较为顺利。但有时可能会遇到一些特殊情况，比如户籍信息存在不完整或不准确的地方，这就需要进一步提供其他辅助材料来证明父女关系，比如出生证明、亲子鉴定报告等。

需要注意的是，不同地区的具体规定和操作流程可能会有所差异。在实际办理过程中，建议先咨询当地派出所，了解清楚所需的具体材料和办理流程，以便能够顺利地开具父女关系证明。同时，要确保提供的材料真实有效，以免影响证明的开具和使用。

法律依据：

《中华人民共和国户口登记条例》 第三条

户口登记工作，由各级公安机关主管。

城市和设有公安派出所的镇，以公安派出所管辖区为户口管辖区；乡和不设公安派出所的镇，以乡、镇管辖区为户口管辖区。乡、镇人民委员会和公安派出所为户口登记机关。

居住在机关、团体、学校、企业、事业等单位内部和公共宿舍的户口，由各单位指定专人，协助户口登记机关办理户口登记；分散居住的户口，由户口登记机关直接办理户口登记。

居住在军事机关和军人宿舍的非现役军人的户口，由各单位指定专人，协助户口登记机关办理户口登记。

农业、渔业、盐业、林业、牧畜业、手工业等生产合作社的户口，由合作社指定专人，协助户口登记机关办理户口登记。合作社以外的户口，由户口登记机关直接办理户口登记。