不算。

在法律上，判断是否为合法夫妻关系，关键在于是否依法办理了登记手续。虽然有孩子，但没有结婚证，这种情况不能认定为合法夫妻关系。

婚姻关系的确立，是以办理结婚登记为法定要件的。只有经过法定程序，领取结婚证，夫妻关系才受到法律的保护和约束。没有结婚证，双方在法律上只是同居关系，而不是夫妻关系。同居关系与夫妻关系存在诸多区别，比如在财产分配、债务承担、继承等方面。

有孩子这一事实，并不能改变双方在法律上的关系性质。孩子的存在，可能会引发一系列与抚养、教育等相关的法律问题，但这与是否为合法夫妻关系并无直接关联。

对于同居期间生育的孩子，父母双方都有抚养的义务。在处理孩子抚养问题时，应当从有利于孩子身心健康的角度出发，保障孩子的合法权益。

如果双方想要确立合法的夫妻关系，可以依法办理结婚登记手续。办理结婚登记后，双方的权利和义务将得到明确和保障，包括夫妻间的扶养义务、财产共有等。

总之，没有结婚证但有孩子，不能算作合法夫妻关系。双方应当根据实际情况，妥善处理好彼此之间的关系和相关事务。

《婚姻登记条例》 第七条

婚姻登记机关应当对结婚登记当事人出具的证件、证明材料进行审查并询问相关情况。对当事人符合结婚条件的，应当当场予以登记，发给结婚证；对当事人不符合结婚条件不予登记的，应当向当事人说明理由。

《中华人民共和国民法典》 第一千零四十九条

要求结婚的男女双方应当亲自到婚姻登记机关申请结婚登记。符合本法规定的，予以登记，发给结婚证。完成结婚登记，即确立婚姻关系。未办理结婚登记的，应当补办登记。