法律解析：

在起诉离婚财产纠纷中，有可能会冻结公司账户，但并非必然。

在财产纠纷诉讼中，是否会冻结公司账户取决于具体情况。如果公司账户与夫妻共同财产或离婚纠纷存在紧密关联，且存在一些特定情形，那么就有可能被冻结。

如果公司是夫妻共同经营，或者其中一方在公司拥有较大权益，而该权益被认为是夫妻共同财产的一部分，那么对方可能会申请冻结公司账户，以确保在财产分割时能够保障自己的权益。

如果一方存在转移、隐匿夫妻共同财产的行为，并且有证据表明可能通过公司账户进行操作，另一方为了防止财产流失，也可能申请冻结账户。

如果离婚纠纷涉及到对公司资产的评估和分割，为了保证资产的现状不发生变化，法院也可能会根据具体情况决定是否冻结账户。

然而，冻结公司账户并非轻易就会发生，法院会综合考虑多方面因素。比如，会审查申请冻结的理由是否充分、是否会对公司的正常经营造成严重影响等。如果冻结账户可能导致公司无法正常运营，影响众多员工的利益和社会稳定，法院可能会谨慎处理或采取其他替代措施。

总之，在财产纠纷中，公司账户是否会被冻结需要根据具体案件情况来判断，不能一概而论。双方在处理此类问题时，应充分考虑法律规定和实际影响，以合理合法的方式维护自己的权益。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十七条

离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。

对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。