协议离婚时，孩子的监护权可以由父母双方协商确定。

在协议的过程中，孩子监护权的归属是一个至关重要的问题。监护权涉及到对孩子日常生活、教育、健康等方面的责任和权利。

父母双方应该以孩子的最佳利益为出发点，进行充分的沟通和协商。考虑孩子的年龄、意愿、生活习惯、教育需求等因素。如果孩子已经具备一定的认知能力，其意愿也可能会被纳入考虑范围。

要明确监护权的具体内容。这包括但不限于与孩子共同生活的安排、对孩子教育的决策、医疗保健的负责等。同时，对于非直接抚养方的探视权也应明确规定，以保障其与孩子保持良好的亲子关系。

如果父母双方能够就监护权达成一致意见，并形成书面协议，那么在离婚程序中，该协议通常会被法院认可和采纳。如果双方无法达成一致，法院将根据相关法律和具体情况来判定监护权的归属。

法院在判定监护权时，会综合考虑以下因素：孩子的年龄和性别；孩子与父母双方的感情和关系；父母双方的抚养能力和条件，包括经济状况、生活稳定性、教育背景等；以及是否存在不利于孩子成长的因素，如家庭暴力、不良嗜好等。

总之，协议离婚时孩子监护权的确定需要父母双方理性对待，以孩子的利益为核心，通过协商或在必要时由法院裁决来明确。这样可以最大程度地减少对孩子的伤害，保障孩子的健康成长。

《中华人民共和国民法典》 第二十七条

父母是未成年子女的监护人。

未成年人的父母已经死亡或者没有监护能力的，由下列有监护能力的人按顺序担任监护人：

（一）祖父母、外祖父母；

（二）兄、姐；

（三）其他愿意担任监护人的个人或者组织，但是须经未成年人住所地的居民委员会、村民委员会或者民政部门同意。