当个人贷款逾期天数大于90天时，还款顺序通常遵循以下原则：

1、优先偿还逾期利息和违约金：由于贷款逾期会产生额外的利息和违约金，这部分费用在还款时应当优先扣除。

2、剩余资金用于偿还本金：在扣除逾期利息和违约金后，剩余的资金应当用于偿还贷款本金。

3、本金清偿完毕后，剩余资金用于支付其他费用：如果逾期后产生的费用超过了剩余本金，那么剩余的资金可能不足以支付所有费用，此时剩余的资金将用于支付其他费用，如罚息、滞纳金等。

建议参考：

在处理逾期贷款时，建议借款人与贷款机构进行沟通，了解具体的还款顺序和可能产生的费用，借款人应当积极筹措资金，尽量减少逾期时间，以避免产生过多的逾期费用，如果借款人确实遇到还款困难，可以考虑与贷款机构协商还款计划或申请延期还款。

相关法条：

《中华人民共和国民法典》第六百七十六条：“借款人未按照约定的期限返还借款的，应当按照约定或者国家有关规定支付逾期利息。”

小编总结：

逾期天数大于90天的个人贷款还款顺序应当遵循先息后本的原则，在处理逾期贷款时，借款人应当积极与贷款机构沟通，了解还款顺序和相关费用，并尽可能减少逾期时间，以免产生过多的逾期费用，如果借款人遇到还款困难，可以考虑与贷款机构协商还款计划或申请延期还款。