离婚时有两个孩子的判决通常会以保障孩子的利益为优先考虑。法院会根据具体情况进行判决，以确保孩子能够得到合适的抚养和照顾。

法院会考虑孩子的最佳利益。这包括孩子的年龄、健康状况、教育需求等因素。法院会尽量确保孩子得到稳定的生活环境和良好的教育条件。

法院会考虑孩子与每个父母的关系。如果孩子与某一方父母的关系更为亲密和稳定，法院可能会判决孩子随该方父母生活，而另一方父母则需要支付抚养费和与孩子保持接触。

法院也会考虑父母的抚养能力和意愿。如果一个父母有更好的经济条件和能力来抚养孩子，法院可能会判决孩子随该方父母生活，并由该方父母负责支付抚养费。但如果双方父母的抚养能力相当，法院可能会判决共同抚养，即孩子与双方父母共同生活，并由双方父母共同负责抚养费用。

法院还会考虑父母之间的关系和沟通能力。如果双方父母能够良好地沟通、合作并为孩子的利益着想，法院可能会判决共同抚养。但如果双方父母之间存在严重的矛盾和冲突，法院可能会判决孩子随其中一方父母生活，以减少孩子在父母之间的纷争中受到伤害。

在离婚时有两个孩子的判决中，法院会综合考虑孩子的最佳利益、与父母的关系、父母的抚养能力和意愿，以及父母之间的关系和沟通能力等因素，以确保孩子能够得到合适的抚养和照顾。最终的判决应当是对孩子最有利的决定。