在双方离婚后，对于有两个孩子的情况，法院通常会考虑以下几个方面来做出判决。

法院会关注孩子的最佳利益。这意味着法院会优先考虑孩子的福祉和发展需求。法院可能会考虑孩子与双方父母的亲密关系、亲子关系的稳定性、孩子的年龄和性别等因素，以确定孩子与哪位父母居住更有利于他们的成长。

法院也会考虑双方父母的能力和条件。法院会评估双方父母的经济状况、居住条件、教育背景、工作稳定性等因素。如果一方父母有更好的经济能力和更适合孩子成长的条件，法院可能会倾向于将孩子判给这一方。

法院也会考虑双方父母的意愿和能力来合理安排孩子的抚养和监护。如果双方能够就孩子的抚养和监护达成共识，法院通常会尊重双方的意愿，并制定相关的协议来确保孩子的权益得到保障。

法院也会考虑孩子与其他亲属的关系。法院可能会考虑孩子与祖父母、叔伯姑舅等亲属的关系，以及这些亲属对孩子的照顾和支持程度。如果某一方父母能够提供更好的亲属支持系统，法院可能会考虑将孩子判给这一方。

在双方离婚后，法院会综合考虑孩子的最佳利益、双方父母的能力和条件、双方的意愿以及孩子与其他亲属的关系，来做出关于孩子抚养和监护的判决。这样的判决旨在确保孩子的权益得到充分保障，使他们能够在一个稳定、健康的环境中成长和发展。