怀孕三个多月的办理方式如下：

1. ：双方自愿离婚，并就、财产分割等问题达成一致意见，可以签订，然后共同到申请。但在女方怀间，男方不得提出离婚，除非女方提出离婚或者人院认为确有必要男方离婚请求。

2. ：如果夫妻双方无法达成离婚，或者存在一方不同意离婚、财产分割或子女问题无法协商一致等情况，可以向人民法院提起。法院会根据双方的具体情况和相关法律规定进行判决。

需要注意的是，在怀孕期间离婚，对于子女的抚养问题需要谨慎考虑。一般来说，两周岁以下的子女，以由母亲直接抚养为原则。但最终的归属会综合多种因素判定，如双方的经济状况、抚养能力、生活环境等。

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十六条

夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。

离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十二条

女方在怀孕期间、分娩后一年内或者终止妊娠后六个月内，男方不得提出离婚；但是，女方提出离婚或者人民法院认为确有必要受理男方离婚请求的除外。