孕期协议离婚办理离婚证，需要双方亲自到婚姻登记机关申请离婚登记，并提交相关材料，经过一定的冷静期后，再共同到婚姻登记机关申请发给离婚证。

在孕期，夫妻双方如果协商一致想要协议，办理离婚证的流程如下。双方应当共同到有管辖权的婚姻登记机关提出离婚登记申请。在申请时，需携带本人的户口簿、身份证、证以及双方当事人共同签署的离婚协议书等材料。离婚协议书应当载明双方当事人的意思表示以及对子女抚养、财产及债务处理等事项协商一致的意见。

婚姻登记机关收到离婚登记申请后，并不会当即发给离婚证，而是会有一个为期三十日的冷静期。在这三十天内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请。冷静期届满后三十日内，双方应当亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证；未申请的，视为撤回离婚登记申请。

需要注意的是，虽然孕期可以协议离婚，但法律对男方提出离婚有一定限制。一般情况下，女方在怀孕期间、分娩后一年内或者终止妊娠后六个月内，男方不得提出离婚；但是，女方提出离婚或者人民法院认为确有必要受理男方离婚请求的除外。这一规定主要是为了保护妇女和胎儿、婴儿的合法权益。

总之，孕期协议离婚办理离婚证需要遵循特定的程序和规定，双方应认真了解相关法律要求，确保离婚手续的合法、顺利办理。同时，也要充分考虑到孕期这一特殊情况，妥善处理好夫妻关系和相关事宜。

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十六条

夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。

离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十七条

自婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请。

前款规定期限届满后三十日内，双方应当亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证；未申请的，视为撤回离婚登记申请。