撤诉后，检察院没有案底。但是，如果发现新的证据证明本案应追究刑事责任，检察院将再次起诉。

什么情况下会留下案底？

造成刑事犯罪的行为将留在案底。警告、拘留、罚款不记录在公安局治安管理处罚中，只有刑事处罚才能进入档案，留下案底。《刑事诉讼法》规定，犯罪时年满十八周岁，被判处五年以下有期徒刑的，应当封存有关犯罪记录。

法律依据：

《刑事诉讼法》第二百八十六条  犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。犯罪记录被封存的，不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。

《中华人民共和国刑事诉讼法》 第十六条 有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：

(一)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;

(二)犯罪已过追诉时效期限的;

(三)经特赦令免除刑罚的;

(四)依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;

(五)犯罪嫌疑人、被告人死亡的;

(六)其他法律规定免予追究刑事责任的。